根据相关法规及搜索结果，旅行社开具的代订机票发票能否抵扣进项税需结合发票类型和内容判断，具体分析如下：

一、不可抵扣的常见情形

代订服务费发票（经纪代理服务）

旅行社代订机票开具的发票若属于“经纪代理服务”“代订机票服务”等类别，属于中介手续费，不能抵扣进项税。这类发票仅反映代理服务费用，而非直接的旅客运输服务费用。

普通发票（非旅客运输服务类）

纸质增值税普通发票或电子普通发票，若内容为“旅游服务”“代订机票产品”等，因不属于税法规定的旅客运输服务范畴，不可抵扣。

例如，携程开具的“代订机票服务”电子普通发票，税目为经纪代理服务（税率6%），不能作为抵扣凭证。

二、可抵扣的特殊情形

取得增值税专用发票

若旅行社提供的是“旅客运输服务”的增值税专用发票，且与企业生产经营相关，可按票面税额直接抵扣。但实务中，旅行社通常采用差额征税政策，无法开具专用发票。

取得航空运输电子客票行程单

若实际取得的是注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单，可计算抵扣进项税：

抵扣公式 =（票价 + 燃油附加费）÷ (1 + 9%) × 9%。

注意：民航发展基金（50元）不计入抵扣基数。

三、操作建议

优先获取行程单或运输服务发票直接通过航空公司或具备运输资质的平台获取行程单，避免通过代理服务开具中介类发票。

确认发票税目为“运输服务”（税率9%）而非“经纪代理服务”。

合规处理代订服务若必须通过旅行社代订，需明确要求其提供行程单或旅客运输服务的专用发票。

避免接受“代订手续费”类普通发票，因其不符合抵扣条件。

四、法规依据

《中华人民共和国增值税暂行条例》第八条明确，可抵扣进项税需取得增值税专用发票、海关缴款书等法定凭证，中介服务发票不在此列。

财政部2019年39号公告规定，旅客运输服务抵扣凭证仅限行程单、车票、运输服务类电子普票或专票。

总结

旅行社代订机票发票能否抵扣，核心取决于发票内容是否属于“旅客运输服务”。若为经纪代理服务类发票，不可抵扣；若取得行程单或运输服务专用发票，可按规定抵扣。建议企业规范票据管理，优先通过直接渠道获取合规凭证。